数理研究科技创新平台主要由数学、物理学、生命科学、计算机科学等相关学科方向组成，涵盖基础数学、应用数学、运筹学与控制论和理论物理四个复旦大学的国家重点学科和遗传学、生态学两个复旦大学国家重点学科的某些研究方向，其宗旨为在数学、物理、生物与信息科学等相关的研究领域内，将平台建设成有国际影响的基础科学科研中心、人才培养中心和国际交流中心。
数理研究科技创新平台由基础数学、应用数学、理论物理、理论生命科学和交叉学科（包括计算系统生物学中心、生物统计研究中心和计算科学与工程研究中心）等五个分平台组成。其相关研究方向负责人在首席科学家的领导下，采取民主决策机制共同处理平台重大事项。事务性工作由平台综合办公室完成。
数理研究科技创新平台致力于研究核心数学、应用数学、运筹学与控制论、理论物理、生命科学、并行计算以及相关交叉学科中的若干基本问题。其主要研究方向集中在（1）复几何与数学物理；（2）代数几何；（3）偏微分方程；（4）非交换几何；（5）动力系统；（6）科学与工程中的建模、理论和算法；（7）金融数学；（8）量子信息和量子计算；（9）现代宇宙学；（10）计算系统生物学；（11）生物信息学；（12）统计遗传学；（13）高端计算和网格计算等研究领域。目前平台计算中心拥有先进的万亿次并行计算机系统，为研究人员提供了良好的工作环境，并形成了以理论推导和大规模科学计算为手段的富有特色的研究体系。
数理研究科技创新平台以固定、客座、兼职等多种形式，汇集了国内外大量一流的研究人员，实现了研究人员的国际化。平台每年邀请大量具有国际水平的专家、学者来校讲学、科研合作和学术交流，其中多数来自海外。
数理研究科技创新平台是以基础理论研究为主导的中心，其主要技术平台为高性能计算机，并由下辖的复旦大学高端计算中心进行维护和管理。目前平台主要设备为一台由128个运算节点组成的惠普集群结构并行计算机，峰值速度为1.56Tfps，linpack值超过1Tfps。
数理研究科技创新平台以 “视野开阔、思想活跃、组织管理能力强的战略科学家”为方向，着手发现和培养高层次创新人才。数理研究科技创新平台研究生的培养和博士后的工作依托于数学、物理学、生命科学和信息学院各院系的管理，形成了由院系进行招生和管理，院系与平台共同培养的灵活机制。平台利用学科群覆盖面广的特点，吸收和培养交叉学科方向的博士后人员。