全国首批博士学位授予点，国家重点学科，拥有医学神经生物学国家重点实验室。现有教授7人，副教授4人。
主要研究方向：
①针刺镇痛的神经生物学机制
②针刺抗缺血性中风的机理
③针刺和中药调节生殖内分泌功能的机制
④针刺改善免疫抑制效应的机制
近年来的主要科研项目和成果：
国家攀登计划（1项），国家"九五"攻关课题（1项），国家自然科学基金重点（1项）及面上（6项）项目等共计235万元；现承担国家自然科学基金重点（1项）及面上（7项）项目，教育部、卫生部、国家中医药局等部委基金（5项），上海市中医药重大项目（1项）等共计310万元。获国家科技进步三等奖（1次）、国家"八五"攻关重大成果奖（1次）、教育部、卫生部、国家中医药局及上海市科技进步奖（一等奖2次、二等奖6次、三等奖6次）。
开设的主要专业课程：
神经生物学等。
毕业生去向：
本专业毕业生主要在高校及科研机构从事中西医结合基础及相关学科的科研、教学工作。
中西医结合基础专业博士生导师简况
| 姓 名 | 主要研究领域 | 所在院、系（所） | 办公电话、Email地址 |
| 吴根诚 | 针刺镇痛的神经生物学机制 | 上海医学院（基础) | 021-64041900-2397 |
| 陈伯英 | 针刺和中药调节生殖内分泌系统功能的机制 | 上海医学院（基础) | 021-64041900-2693 |
| 王彦青 | 慢性痛和针刺镇痛的机理研究 | 上海医学院（基础) | 021-54237496 |